Im Jahre 1233 wird Cavajone zum ersten Mal urkundlich erwähnt. Damals diente es als Maiensäss einiger Veltliner Bauern. Es wird angenommen, dass Cavajone erst im sechzehnten oder siebzehnten Jahrhundert ganzjährig besiedelt wurde, als einige Veltliner sich hier vor Epidemien, Kriegen und Unruhen in Sicherheit brachten. Die Dorfkirche wurde im Jahre 1777 erbaut, ihr Standort oberhalb des Dorfes war eine Kompromisslösung, damit es im Sommer auch den Bewohnern der oberhalb des Dorfes gelegenen Maiensässen möglich war, die Messe zu besuchen.

Am 01.03.1896 wurde in Cavajone eine Postablage eröffnet.